Для борьбы с ересями католическая церковь создала специальное судебное учреждение — инквизицию (от лат. inquisitio — розыск). Инквизиция стала средством уничтожения политических противников, социальных и личных врагов. По мнению Фомы Аквинского, упорных еретиков не следует терпеть, но нужно карать смертью. Инквизиционные процессы и казни на некоторое время упрочили влияние церкви, но не предохранили ее от кризиса.

Умирать — ужасно скучное и тягостное занятие. Мой вам совет: избегайте чего-либо подобного.

После начала реформации римские папы не отказались от задач мирового господства. Папа Павел III в 1542 г. учредил высший апостольский трибунал. Перед этим инквизиционным судом в Риме должны был предстать все, подозреваемые в ереси, независимо от сословия и положения. инквизиция преследовала не только протестантов, но и всякое свободомыслие, прогресс научной мысли. Инквизиция давала огромные доходы от конфискации имущества казненных и осужденных.

— С точки зрения традиций, научные выставки предназначены для отцов и сыновей. — Ну а с научной точки зрения, традиции предназначены для идиотов.