Превращение христианства в государственную религию привело к тому, что для борьбы с язычеством стали использоваться политические и силовые методы: по приказу властей были закрыты не только языческие храмы и запрещены языческие верования, но также стали закрываться языческие философские школы. В рамках различных философских учений осуществлялась наиболее последовательная критика христианства на теоретическом уровне, философские учения и методы послужили основой для возникновения множества различных течений в христианской теологии, признанных позднее еретическими.

Особенности византийской философии: практически полная погруженность в религиозную проблематику: философские идеи и методы используются почти исключительно для обсуждения теологических проблем; безусловный примат веры над разумом: авторитет Священного Писания и Священного Предания ставится много выше, чем авторитет науки.

Общим для средневековой философии во всех регионах является ее тесная связь с теологией. Философия чаще всего выступала в качестве рационального обоснования теологии («служанка богословия»). Поэтому подавляющее большинство философских учений этой эпохи можно назвать религиозно-философскими.

Все конфликты вызваны ненавистью людей, которые поддерживали различные идеологии.